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celldata

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更新日期:2023-10-19

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  评价FFPE衍生的RNA的质量和数量,以下技术通常用于评估RNA样本的质量:浓度简单使用:紫外/Vis光谱(例如!纳米滴™)或使用RNA特异性荧光染料(例如!Qubit™)!用凝胶或毛细血管测量RNA的完整性!凝胶电泳,例如在安捷伦生物分析仪上,并以RIN数或DV表示200百分比.放大性的测量,这依赖于直接的对经过充分的化学去修饰或未交联而被逆转录酶和聚合酶处理的RNA的数量!所选择的方法是定量RT-PCR,结果可以用Ct数或RNA的数量表示.

  润滑步骤:我们建议在pH8使用三或EDTA缓冲区(未提供)!或者,也可以使用无核酸酶的水。正在准备该组织DNAstorm™套件可用于5-10µm厚的FFPE段.对于每个隔离装置,应使用1至4个部分!组织的总表面积应在10至100mm2之间!或者,同等量的组织可以使用组织研磨机/均质器或小研钵和杵进行研磨或压碎!细胞数据科学RNAstorm™新鲜细胞和组织试剂盒——快速分离高质量的总RNA优点:◆短短20分钟即可获得高质量的总RNA◆简单的工作流程可产生多达120µgRNA◆包括DNase处理◆无苯酚-氯仿,无乙醇沉淀应用领域二代测序,基因芯片,PCR,定量PCR试齐盒类型手动(核酸纯化柱)样品量多达107动物细胞高达30毫克的动物组织提取时间20分钟试剂盒成份裂解缓冲液FRB缓冲液冲洗缓冲液DNase缓冲液DNaseI核酸纯化柱从单个ffpe样品中提取双dna/rna的方法该方案的修改允许从相同的FFPE输入组织样本中提取DNA和RNA!

  d)继续孵育上清液,再培养在72˚C下运行5小时(总共2小时,包括初的30分钟),然后按照指示进行RNAstorm™协议的步骤7步(添加绑定缓冲区)和所有剩余步骤!e)使用步骤b)中的颗粒,其中包含DNA,作为DNAStorm™试剂盒手册的步骤A5(或B8,取决于脱亲和选择)的输入.f)继续执行DNAStorm协议的步骤A5(或B8),向颗粒中添加200µL的CAT5™缓冲区,然后按照DNAStorm™协议的指示继续操作.

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  CellDataSciences专注于改善对具有挑战性的生物样本的遗传和基因组数据的获取,使用我们的试剂盒,FFPE样品的用户即使从质量较差的样品中也可以自信地提取RNA。CELLDATA的使命是在具有挑战性的生物样本上使用先进的分子分析技术,并提高基础科学和个性化医疗的关键遗传和基因组数据的恢复。更高质量的核酸大多数现有方法依靠热量来去除交联和加合物,这仅部分有效,并导致不稳定核酸的额外断裂。相比之下,RNAstorm™和DNAstorm™套件中包含的催化CAT5™技术大大加速了甲醛损伤的去除,并允许回收更高质量的核酸!

  由于通过下一代测序方法获得了丰富的信息,对分析这些患者数据的需求将继续增加.然而,核酸提取方法到目前为止,还不能提供可靠测序所需的核酸质量!NGS文库的制备依赖于多个酶的步骤,包括逆转录和扩增,这需要具有高完整性和扩增性的核酸。RNAstorm™试剂包提供了一个专门为下游应用程序量身定制的样品处理解决方案,并允许终用户可靠地与具有挑战性但有价值的福尔马林固定样品一起工作!细胞数据科学RNAstorm™FFPE试剂盒——提取FFPE组织RNARNAstorm™的优点:◆减少提取过程中RNA损伤◆除去RNA化学修饰和加合物◆获得更完整的RNA(200nt以上RNA的百分比)◆高产量的可扩增RNA◆RNA测序的佳解决方案CAT5™催化技术:◆自有知识产权的化学催化剂:可消除甲醛的交联和变性◆比使用基于加热方法产量更高◆高质量:RNA片段极少应用领域:RNA测序,PCR,定量PCR,逆转录PCR,生物芯片操作方式手动(50个核酸纯化柱)核酸酶处理已包含样品形式福尔马林固定样品(石蜡嵌入或固定)样品量1-4个切片(每个5-10µm)分离的RNA类型总RNA(包括miRNA)提取时间50分钟操作时间试剂盒成份核酸纯化柱蛋白酶核酸酶核酸酶缓冲液CAT5™试剂裂解缓冲液洗涤缓冲液结合缓冲液脱石蜡试剂关于该工具包活检和手术标本通常通过用甲醛固定来保存。


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