超声波还能对生物体产生一种很特别的效应，称为“空化效应（或空穴效应）”。也就是说，超声波的高频振动，会使受到震荡的液体产生肉眼看不见的微小气泡，这些气泡受到声波的挤压，会瞬间缩小然后爆裂，同时释放出大量的能量，瞬间可以达到数千度的高温，把周围的组织灼伤。此后，高温会把水分解成氢自由基和氢氧自由基，这些自由基到处乱窜，走到哪儿就破坏到哪儿。因此空化效应会对周围的组织造成高温和自由基双重损伤，这是超声波最厉害的一招。